マクロライド耐性百日咳菌とは，百日咳の第一選択薬であるマクロライド系抗菌薬に耐性を示す百日咳菌を指す．耐性は 23S rRNA 遺伝子上の A2047G 変異により生じ，中国では臨床分離株の多くを耐性株が占めている．日本でも 2025 年の流行期に耐性株が高率に検出され，分子系統解析によって，近年検出されている株が中国で拡大している系統に由来する可能性が示された．マクロライドに代わる確立した治療薬は限られており，とくに新生児や妊婦では使用可能な薬剤に制約がある．今後は分子疫学的監視の強化と，治療法の臨床的有効性に関するエビデンスの蓄積が求められる．